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2016 基因大数据创业创新POG大赛---基因测序数据处理一体机评选活动正式启动

【数据猿导读】 随着基因测序技术的不断发展,基因测序成本逐年下降,随之迎来基因测序应用市场的创新创业高潮。由上海大数据联盟、数据猿、中国科学院北京基因组研究所、中国信息通信研究院四方共同举办的“2016 基因大数据创业创新Power of Gene大赛”活动现已正式启动

2016 基因大数据创业创新POG大赛---基因测序数据处理一体机评选活动正式启动

随着基因测序技术的不断发展,基因测序成本逐年下降,随之迎来基因测序应用市场的创新创业高潮。但与此同时,如何对海量测序数据进行处理加工,成为行业面临的一大难题。基因数据的处理加工过程受计算资源、软件程序、处理流程和数据库等多种因素的制约,已经远远落后于测序数据的增速,在IT技术与生物信息的交叉领域存在着巨大的市场机会。

本次由上海大数据联盟、数据猿、中国科学院北京基因组研究所、中国信息通信研究院四方共同举办的“2016 基因大数据创业创新Power of Gene大赛”活动(以下简称:POG大赛)期望能够整合各方资源,提高社会各界对于基因数据处理流程的关注度与参与度,挖掘出能够有效处理海量测序数据的一体机、算法和流程,缩短基因数据的周期、提升数据处理质量,从而推动基因测序行业健康快速发展。

同时,也期望能促进基因产业链上下游、生物医疗领域与大数据创新技术领域的跨界交流,以及行业领军企业与创新创业企业间的交流互动。

寻找最棒的基因测序数据处理一体机

“一体机”是基因测序环节中重要的一环,其数据处理与存储能力已经成为制约整个行业快速发展的瓶颈所在。国内市场虽然起步晚,但已经有众多企业在积极尝试各种形式突破现有的垄断格局。

本次大赛,组委会将广泛征集业内优秀的基因测序一体机厂商参加本次评测,通过“近源处理”的模式,尽可能在测序仪器测对原始下机数据进行直接处理,从而缩短数据分析的周期,降低数据处理的成本,推动基因产业的进一步发展。

本次“一体机”评测活动目标

“专家评审团”将对本次参加评审的“一体机”进行实地评测,以期通过本次评测:

1、对接基因测序数据处理的供需双方,探索海量基因数据处理的可行模式;

2、按照统一数据处理标准对各厂家一体机进行集中评估评测,并向通过测试的一体机颁发第三方证书,以期降低基因测序数据处理领域内供需双方的沟通和互信成本;

3、本次活动颁发的行业认定证书由“中科院北京基因组所”、“上海大数据联盟”联合颁发。

业内顶级专家评审团亲自把脉指导

本次“POG大赛”专家评审团阵容强大。不但汇集了包括英特尔生命科学家余昶、云健康医疗科技集团总裁金刚、药明康德生物信息主任戴珩等业内知名厂商的专家;也云集了国家人类基因组南方研究中心主任助理与测序部负责人王升跃、上海超级计算中心副主任李根国、中国科学院“百人计划”研究员方向东、中山大学国家超级计算广州中心大数据部门负责人王丙强等知名大佬级官方专家学者,总人数将超过15位。

强大的专家评审团将在本次大赛中全程协助参赛团队,不但会以小组为单位在线上提供专业的指导意见,也会莅临线下亲自答疑解惑。

------查看活动官网详情,请点击这里------

(专家排名不分先后)

部分评审专家简介

评审专家——楼敬伟

楼敬伟是医学博士,美国City of Hope国家医学中心访问学者,上海市2010年浦江人才计划和上海市科委重点支持项目获得者。

现为上海张江转化医学研发中心总经理、上海宝藤生物医药科技有限公司董事长。带领包括五位中组部千人计划科学家的专业团队,从事医学大数据集成分析引擎和临床应用的开发、个体化医学检测服务和转化医学产业化研究,在全国范围内建立了超过20家大型三甲医院的联合实验室。

该网络,年门诊和住院患者数高达3700万,打造创新的网络式科研体系,以此积累多种疾病相关的海量数据;是目前全球最大的医学大数据网络,试将带来医学产业的颠覆性变革。该项目近年来获得国家863和上海市重大项目、国家基础研究重大设施等项目的支持,致力于建设全球领先的“智能医学”大数据系统,推动我国医学大数据产业发展。

评审专家——李根国

李根国是上海超级计算中心副主任,博士,计算数学专业,教授级高工。

主要从事高性能计算方法研究及其在工业和工程领域应用。近十几年来一直从事飞机、汽车、船舶等工业产品以及大型地下工程等领域的高性能计算应用研究工作,积累了大量有限元分析,动力学仿真等方面的应用经验。担任中国电子学会大数据和云计算专家委员会委员,中国计算机学会高性能计算专业委员会委员。

先后在重要学术刊物上发表了30多篇文章,负责和参加了多项国家自然科学基金、“863”项目的科研工作。所承担的项目成果分别获得国家科技进步奖二等奖一项,上海市科技进步奖一等奖二项、二等奖一项。曾获得第五届“上海IT青年十大新锐”荣誉称号,2011年获得国务院政府特殊津贴。

评审专家——金刚

金刚博士是国家“千人计划”特聘专家和上海市“千人计划”特聘专家,中科院“百人计划”特聘专家,上海千人计划专家联谊会大健康专委会主任,中国医药生物技术协会精准医疗专委会常委,曾任中科院上海生命研究院、上海交通大学医学院健康科学研究所研究员,博士生导师。

金刚博士现任云健康医疗科技集团总裁/创始人,云健康基因科技(上海)有限公司总裁/创始人。上海生物芯片公司暨国家生物芯片上海工程研究中心共同发起人和创始主任,上海伯豪生物技术有限公司共同发起人和创始总裁。

金刚博士本科毕业于复旦大学医学院(原上海医科大学),毕业后留校在复旦中山医院工作研究,后留学美国加州大学圣地亚哥分校生物工程系留学完成博士和博士后,师从国际著名华裔生物科学家、美国科学院/工程院/医学院/艺术暨自然科学院/中国科学院/台湾中央研究院六院院士、2011年美国总统最高科学奖章获得者钱煦教授(Prof Shu Chien)为导师。

金刚博士曾担任美国著名Salk生物研究所功能基因组学实验室暨生物芯片中心主任;美国普度制药公司 (Purdue Pharma) 基因组学部总监主持基因组学在新药研发中的应用研究。金刚博士是美国和中国基因组学技术应用研究领域早期开拓者和资深专家之一,也是国内基因组学,转化医学,分子诊断,和个性化医疗,精准医学领域的创新创业型领军人才之一,具备跨界合作,资源整合,发展共赢的理念,是有领导力和影响力的整合型创新管理人才。

评审专家——王升跃

王升跃博士为国家二级研究员,博士生导师,国务院“政府特殊津贴”专家,上海市领军人才。

现任国家人类基因组南方研究中心主任助理、测序部负责人,兼任国家转化医学中心(上海)高通量测序平台负责人,兼任全国生化检测标准化技术委员(SAC/TC387)委员。

主要研究方向为基因组学,包括肿瘤、遗传病、病原生物和药用植物等基因组学研究。先后承担了国家“973”,“863”,“传染病重大专项”等省部级以上项目/课题20余项。

在Nature、Science、Nature genetics、Nature medicine等国际一流学术杂志上发表或参与发表论文近90篇,参与发表专著2篇。获国家发明专利6项。获国家“自然科学奖”二等奖 2项;教育部“自然科学”一等奖 1项;上海市 “自然科学奖”一等奖2项。

评审专家——孔华威

孔华威是高级工程师 致公党员,上海张江科技创业投资有限公司首席科学家、上海大数据产业技术创新战略联盟 秘书长、国家科技部中国火炬创业导师。

孔华威1987-1990毕业于浙江大学,获得理论物理硕士学位,1987毕业于北京大学获得理论学士学位。1998年进入中科院计算技术研究所工作,其研究方向为网格计算。先后单位曙光信息产业集团营销副总、织女星网格技术有限公司副总裁以及龙芯产业化联盟副秘书长等职。2008年来担任中科院计算所上海分所所长,主要负责院地合作、技术转移和开发、孵化器管理和产业研究等工作。2011年开始TMT投资,负责投资项目有七牛云存储、中晟光电、睿励仪器、敏狐科技、芯源科技等。

2008年3月12日创办新经济沙龙目前已举办205期,是长三角最有影响力的新经济论坛。也是IC咖啡创始发起人之一。著有《创新生态---让企业互相吃起来》 、《数字货币的崎岖进化》 、《后会无期 有趣就好---互联网思维的一孔之见》 ,也是福布斯中文网专栏作家。

评审专家——徐莹

徐莹为应用数学博士,美国爱荷华州立大学毕业。

现任上海超级计算中心云计算与大数据部工程师,上海大数据联盟秘书长助理。主持过国家自然科学基金,上海浦江人才计划,作为主要参与者参加过国家863项目3项。主要研究领域包括,并行算法及优化,并行可视化等,PaaS云。

评审专家——王丙强

王丙强,男,2005年起在上海超级计算中心工作,2010年加入华大基因担任高性能计算研发部门主管。

2016年起,王丙强在中山大学国家超级计算广州中心担任大数据部门负责人,在超算系统和云平台上开发了一批生物信息应用,是BMC Bioinformatics、IEEE系列会议如CloudCom, Cluster, CCGrid, IPDPS等审稿人,发表有论文二十余篇。

评审专家——方向东

方向东博士是中国科学院“百人计划”研究员;

中国科学院大学生命科学学院、医学院、中丹学院教授、博士生导师;

国家“十三五”重点研发计划“精准医学研究”重点专项项目首席科学家;

国家“十三五”重点科研专项财政部预算评审专家;

国家重点研发计划“干细胞及转化研究”等重点专项项目评审专家;

国家自然科学基金委员会医学科学领域血液学科评审组专家;

国家重大科学仪器设备开发专项项目技术专家组委员;

国家卫生计生委“个体化医学检测技术”培训专家;国家食品药品监督管理局“医疗器械技术”审评专家;

国家科学技术部“人类遗传资源管理”专家、国家卫生计生委临床遗传专科委员会和中国遗传学会遗传咨询分会专家委员;

中国医药生物技术协会生物医学信息技术、中国生物工程学会计算生物学与生物信息学、中国生理学会血液生理等专业委员会委员;

人民卫生出版社系列期刊管理委员会常务委员、“精准医学”国家出版工程图书《转录组学与精准医学》主编、Genomics Proteomics Bioinformatics和《发育医学电子杂志》副主编、《遗传》编委;

中国科学院“肿瘤个体化治疗和系统生物学”科技创新交叉与合作团队负责人。

活动咨询

Grace:18601297396

Susie:15083112127

大赛官网http://www.datayuan.cn/jysc.htm

也可扫以下二维码查看官网信息与报名

POG大赛组织单位

指导单位: 上海市经信委、 上海市科委、上海市卫计委

主办单位: 上海大数据联盟、数据猿、中国科学院北京基因组研究所、中国信息通信研究院

联合主办:上海大数据产业基地(市北高新)、上海超级计算中心、Intel、科赛网、测序中国、贝壳社


来源:数据猿

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