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承启医学搭建基因测序云平台,从数据分析切入精准医疗市场

【数据猿导读】 2016年,中国科技部最新发布的“国家重点研发计划”中,精准医疗位列国家重点研发计划首位。随着测序成本的下降、基因大数据分析的快速发展, 精准医疗正迎来风口。据BBC Research预测,2015年全球精准医疗市场规模近600亿美元,今后5年年增速预计为15%,是医药行业整体增速的3至4倍...

承启医学搭建基因测序云平台,从数据分析切入精准医疗市场

2016年,中国科技部最新发布的“国家重点研发计划”中,精准医疗位列国家重点研发计划首位。随着测序成本的下降、基因大数据分析的快速发展, 精准医疗正迎来风口。据BBC Research预测,2015年全球精准医疗市场规模近600亿美元,今后5年年增速预计为15%,是医药行业整体增速的3至4倍。

承启医学专注于为精准医疗提供基因解决方案,在2014年开始做产业化技术平台,2016年初公司注册成立。

在精准医疗中,基因检测公司提供的服务全流程包括三个部分:样本处理、测序、数据分析。“与其他基因检测公司一样,承启医学也提供全流程服务(特别是超微量核酸建库测序等前沿项目),此外,还单独提供数据分析业务,数据分析与临床解读是我们的强项。在样本处理环节中,外泌体、超微量建库、RNC-RNA等高难度样本处理也是我们的特色。” 承启医学的CEO余卓称。

在数据分析这块,承启医学的高通量基因数据云分析平台,基于其自主研发的高精度FANSe系列算法搭建,主要包括DNA、大小RNA、翻译组、16S、宏基因组等分析模块,可进行基因组和转录组的多层面分析。该平台操作简单,用户不需要相关的专业背景,只需通过网络将基因测序数据上传到云端,一键式分析,就能快速高效地获取关于基因数据的生物学及医学解读结果。

“目前基因检测行业最大的问题是测序数据的准确性,许多基于测序的结果都不可重复。比如同一个样本送到不同公司做基因检测,经常会拿到不同的结果。如果基因测序本身不准,会直接导致健康咨询或诊断环节出现假阳性、假阴性,这与精准医疗背道而驰。除了准确性问题,还有一个临床医学解读问题。如果只有生物学信息,没有临床医学解读,精准医疗也无从谈起。”余卓称。

承启医学的云平台数据分析能在很大程度上解决“准确性”和“医学解读”这两个问题。“在“数据准”这个层面,我们的FANSe比对算法由首席科学家张弓教授从2008年起开始研究,能很好地克服传统算法中精度不足、实验结果受制于操作经验、容错能力差的问题,修正样本处理及测序过程产生的误差,实现高精度的测序数据分析。此外,该云平台具备高效率的批处理能力,能承担海量数据计算任务。在达到同样甚至更高精度的条件下,FANSe系列算法比传统算法所需的测序通量更低,从而显著降低测序成本。 FANSe系列算法曾获得国际人类蛋白质组计划的接纳和认可,其中大量成果都标注引用了FANSe算法。”

在“医学解读”这一块,承启医学凭借自身的算法优势,专门与大型三甲医院的骨干医师团队合作,自建了完整的基因数据临床解读库。因此,对于检测出的人体基因信息,该数据库可提供可靠的临床解读与指导。

关于另一大优势——样本处理,余卓表示,目前液体活检有外泌体、CTC和ctDNA检测三种方式,不过相比于CTC、ctDNA,外泌体的提取与富集比前两者更难,因此业内做外泌体全流程检测的公司相当少,而承启医学目前能做这三种检测,特别是外泌体的全流程检测。外泌体在肿瘤早期筛查、转移和预后监测中能发挥很大的作用。此外,CTC和ctDNA检测一般只应用于肿瘤,而外泌体的应用不局限于肿瘤,还能扩展到其他疾病。不过,目前外泌体还处于临床科研试验和数据积累阶段,还不能大规模进行临检。

基于样本处理和数据分析优势,承启医学目前的业务模式有3种。第一块是给医学科研机构提供基因检测科研服务。这种服务有两种形式:涵盖样本处理、测序和数据分析的全流程服务,及单独的数据分析服务。“目前我们的客户包括20多家医院及医学院,项目金额从几万到百万元不等。数据分析项目约占20%~30%,这个比例在逐步增加。”

与承启医学合作医疗机构中,医生可以方便使用其云平台,来解读相关的基因数据。此外,承启医学还在帮助某些医院定制专属云平台,以应对不同医院的不同疾病检测与研究项目。“这些医院一般都建有自己的精准医疗中心。不过目前国内这样的医院数量很少,找我们定制专属云平台的医院目前只有两家。”

第二种业务模式是第三方临检,给医院及患者提供基因检测服务。目前,承启医学的临检牌照正在申请中。除了自有临检牌照外,承启还与其他的临检机构合作,为他们提供高端服务技术支持。

第三块业务模式是针对消费者的健康管理服务。承启医学会和健康服务机构合作,比如体检中心、养生会所、高端养老机构,一起为消费者提供服务。余卓表示,“我们可以为健康人群提供基因信息及医学解读,包括疾病易感基因、个体特质、用药参考等等。健康服务机构则会根据个体情况为客户提供后续的健康管理服务。”

目前承启医学的主要收入是在医学科研这一块。对于第三方临检和健康管理服务,余卓称,这两块市场目前还处在培育期,是未来几年市场的最大爆发点。

承启医学目前的团队规模30多人。首席科学家张弓教授主攻大规模测序领域,熟悉各种NGS平台,并自主开发了从底层分析到高级应用的一系列超高精度算法。其建立了“翻译组学”新领域,使癌症和感染等重大疾病有了全新的切入视角,被人类蛋白质组组织(HUPO)称为人类蛋白质组计划的核心支柱之一。近五年在《自然》等国际权威杂志上发表论文20多篇。医学专家金哲教授来自约翰霍普金斯医学院,主要从事癌症诊断的分子生物学方法研究,在肿瘤的分子诊断研究领域中取得了丰硕的成果。CEO余卓来自ICT行业,公司经营及管理经验丰富。

承启已完成了千万元级别的天使轮融资,后续将根据业务情况启动A轮融资。


来源:36kr

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